《天體運行論》出版后很少引起人們的注意。一般人不能了解，而許多天文工作者則只把這本書當作編算行星星表的一種方法?！短祗w運行論》在出版后的70年間，雖然遭到馬丁·路德的斥責，但未引起羅馬教廷的注意。

后因布魯諾和伽利略公開宣傳日心地動說，危及教會的思想統(tǒng)治，羅馬教廷才開始對這些科學家加以迫害，并于公元1616年把《天體運行論》列為禁書。然而經(jīng)過開普勒、伽利略、牛頓等人的工作，哥白尼的學說不斷獲得發(fā)展，恒星光行差、視差的發(fā)現(xiàn)，使地球繞太陽轉(zhuǎn)動的學說得到了令人信服的證明。

哥白尼的學說不僅改變了那個時代人類對宇宙的認識，而且根本動搖了歐洲中世紀宗教神學的理論基礎(chǔ)。“從此自然科學便開始從神學中解放出來”，“科學的發(fā)展從此便大踏步前進”。