陳廷敬的上疏，被朝廷采納了，并根據他所提內容，規(guī)定了若干條文，下諭實行。

過了一段時間，云南巡撫王繼文以軍餉為名，動支庫銀并私自A錢。陳廷敬以其溺職不忠，前后銀數贏縮相懸，上疏彈劾。

康熙廿五年（1686年），他任工部尚書。同學士徐乾學奏進《鑒古輯覽》，康熙認為這本輯覽有參閱價值，決定留下來通讀。他在工部尚書任內，還纂輯三朝《圣訓》、《政治典訓》、《方略》、《一統(tǒng)志》、《明史》等，陳廷敬并充總裁官。

康熙廿六年（1687年）調戶部，又調吏部。第二年，他的親戚因貪贓被劾罷，使他身受連累，對他打擊較大。之后，他借口父年八十一歲，盼望相守為由，要求解任回鄉(xiāng)。清廷答允陳廷敬的請求，免卻了他在朝中的職務，但繼續(xù)擔任修書總裁官。

康熙廿九年（1690年），清廷又起用陳廷敬為左都御史，直至文淵閣大學士兼吏部尚書。

康熙四十九年（1710年），皇帝下詔，命令張玉書、陳廷敬領導編纂一部大型字典。第二年，張玉書病逝，陳廷敬獨任總裁官。這部大字典組織了三十多人的編輯班子，陳廷敬的兒子陳壯履也在其中。父子留名于一書，一時傳為美談。這部字典是在前人《字匯》和《正字通》的基礎上增補充實而成的，共收四萬七千多字，是我國古代歷史上收字最豐富的字典。后來定名為《康熙字典》。雖然字典問世時，陳廷敬已經去世，但他為編纂這部字典所付出的心血和作出的貢獻，為后人所敬仰。

陳廷敬一生著述很多，有《午亭文編》、《尊文閣集》、《河上集》、《杜律詩》、《老姥掌游記》、《三禮指要》、《說巖詩集》等。他的詩Tone “清雅醇厚”，很得康熙皇帝的贊賞。

康熙五十一年（1712年）三月，陳廷敬病的很嚴重，康熙遣御醫(yī)前往診視。很不幸，到了四月他就去世了，終年七十三歲，康熙率大臣侍衛(wèi)奠灑，并令各部院滿、漢大臣前往吊祭。康熙皇帝親筆寫了挽詩，賜祭葬典禮，十分隆重。謚曰文貞。生前身后獲得皇帝如此敬重，幾近完人！