1935年，學(xué)校開辦研究生教育。

1936年，學(xué)校成立農(nóng)學(xué)院，從而發(fā)展成為有文、法、理、工、農(nóng)5個學(xué)院15個系2個研究所的綜合大學(xué)。

1937年，國立武漢大學(xué)與國立中央大學(xué)（1949年更名南京大學(xué)）、國立清華大學(xué)、國立北京大學(xué)和國立浙江大學(xué)統(tǒng)一進(jìn)行招生考試，從而躋身“民國五大名校”。

1938年，因武漢會戰(zhàn)爆發(fā)，國立武漢大學(xué)被迫西遷四川樂山繼續(xù)辦學(xué)，農(nóng)學(xué)院并入國立中央大學(xué)。

武漢淪陷后，日軍將武大校園辟為其中原司令部。

1945年8月15日，日本宣布無條件投降。同年9月1日，國立武漢大學(xué)成立復(fù)校委員會。

1946年，武漢大學(xué)恢復(fù)農(nóng)學(xué)院，設(shè)立醫(yī)學(xué)院，并遷回武昌珞珈山，設(shè)有文、法、理、工、農(nóng)、醫(yī)6個學(xué)院21個系8個研究所。

1947年，學(xué)校設(shè)立醫(yī)學(xué)院及其附屬醫(yī)院，形成了文、法、理、工、農(nóng)、醫(yī)6大學(xué)院21個系8個研究所。 

建國之后

1949年武漢解放時，國立武漢大學(xué)被中國共產(chǎn)黨接管并更名為武漢大學(xué)，繼續(xù)辦學(xué)。

1950年，湖南大學(xué)水利系劃歸武漢大學(xué)，與土木系水利組合并，成立水利系；武漢大學(xué)醫(yī)學(xué)院從武漢大學(xué)分出，與上海同濟大學(xué)醫(yī)學(xué)院合并成中南同濟醫(yī)學(xué)院（今華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院）。