1908年春，同學要求撤換不稱職教師舉行罷課，學校一度停辦，竺可楨乃于暑假后轉入復旦公學學習。

1908年，美國國會正式通過退還部分“庚子賠款”，將中國留學潮引向美國。此時的竺可楨，正就讀于唐山路礦學堂（今西南交通大學），他“最熱烈的希望是要出洋到歐美”。

1909年，竺可楨考入唐山路礦學堂（今西南交通大學）學習土木工程，學習成績居全班第一。

二、美國留學

1910年，竺可楨考取第二期留美庚款公費生，他因中國是以農(nóng)立國，遂選入伊利諾大學農(nóng)學院學習。畢業(yè)后，即轉入哈佛大學地學系，潛心研讀與農(nóng)業(yè)關系密切的氣象學。

1914年，在美國康奈爾大學留學的任鴻雋、楊銓等人提議組織一個科學社，并創(chuàng)辦雜志向國內介紹科學知識和科學思想。不久，科學社及其刊物就隨其創(chuàng)辦人一同轉到了哈佛大學。

1915年10月，科學社正式定名為“中國科學社”。竺可楨成為“中國科學社”第一批成員，并積極參與社務活動。他從《科學》第2卷第2期發(fā)表文章以后，成為《科學》雜志最重要的作者之一。

1915年竺可楨獲得哈佛大學碩士學位后，留在哈佛繼續(xù)深造竺可楨也是中國科學社最重要的領導人之一。

由留美學生創(chuàng)建的中國科學社及其刊物《科學》雜志，使科學救國思想的宣傳有了相對固定的陣地和代表人物，并最終促使科學救國思潮的形成這期間，他先后發(fā)表了《中國之雨量及風暴說》、《臺風中心之若干新事實》等多篇論文，于1917年被接納為美國地理學會會員，并獲伊麥蓀獎學金。